每年,欧洲有超过67万人因耐抗生素病原体而患病,3.3万人死于感染。尤其令人担心的是对多种甚至所有已知抗生素具有耐药性的病原体。其中一种是鲍曼不动杆菌,今天最让人害怕的是“医院里的超级细菌”。
据估计,高达5%的医院获得性感染和十分之一的导致死亡的细菌感染可仅归因于这种病原体。根据世界卫生组织(WHO)的说法,这使得鲍曼不动杆菌成为一种迫切需要开发新疗法的病原体。
了解哪些特征使鲍曼不动杆菌成为病原体是实现这一目标的先决条件之一。为此,由法兰克福歌德大学的Ingo Ebersberger教授和LOEWE转化生物多样性基因组学中心(LOEWE- tbg)领导的生物信息学家正在比较各种不同不动杆菌菌株的基因组和其中编码的蛋白质。
关于哪些基因对致病性起作用的结论首先可以从危险菌株和无害菌株之间的差异中得出。
由于缺乏合适的方法,到目前为止,相应的研究主要集中在一个菌株中是否存在一个基因。然而,这忽略了一个事实,即细菌可以通过修改现有的基因来获得新的特性,从而也可以通过修改由它们编码的蛋白质来获得新的特性。
这就是为什么Ebersberger的团队开发了一种生物信息学方法来跟踪沿着进化谱系的蛋白质修饰,并且现在与来自法兰克福歌德大学分子生物科学研究所和医学微生物学和感染控制研究所的微生物学家合作,首次将这种方法应用于不动杆菌。这项研究发表在《公共科学图书馆遗传学》杂志上。
在此过程中,研究人员集中研究了毛发状细胞附属物,即IVa型(T4A)菌毛,这种细胞附属物普遍存在于细菌中,并用于与环境相互作用。它们一方面存在于无害细菌中,甚至被认为是某些病原体毒力的关键因素,这表明T4A菌毛在进化过程中反复获得了与致病性相关的新特征。
研究小组可以证明,位于T4A菌毛尖端的蛋白质ComC对其功能至关重要,在致病性不动杆菌菌株组中表现出明显的变化。即使不同的鲍曼不动杆菌菌株也有不同的这种蛋白质变体。这使得生物信息学家Ebersberger把T4A菌毛比作一个多功能的园艺工具,它的把手总是一样的,但是附着物是可以互换的。
埃伯斯伯格说:“通过这种方式,可以在短的进化时间内实现剧烈的功能改变。”“我们假设在T4A菌毛方面不同的细菌菌株与环境的相互作用也不同。例如,这可能决定病原体在人体的哪个角落定居。”
其目的是利用对病原体内意想不到的高度多样性的了解来改善鲍曼不均匀杆菌感染的治疗,正如Ebersberger解释的那样,“基于我们的结果,有可能开发出针对特定病原体菌株的个性化治疗方法。”
然而,Ebersberger和他的同事们的研究也揭示了一些其他的东西:以前关于鲍曼不动杆菌比较基因组学的研究可能只揭示了冰山一角。埃伯斯伯格说:“我们的方法在解决寻找病原体特征的可能成分方面取得了很大进展。”
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